Der größte Teil des Nationalparks Stilfserjoch liegt auf Südtiroler Seite im Vinschgau. Zwischen den Talböden bei Latsch auf 650 m Höhe und den hochalpinen Gletschergebieten jenseits der Baumgrenze auf knapp unter 4000 m Höhe finden sich im Nationalpark Stilfserjoch alle alpinen Klimazonen. Um dieser Vielfalt gerecht zu werden, wurden fünf Nationalparkhäuser eingerichtet, welche die Geschichte, Geologie, Flora und Fauna der vielseitigen Region bespielen.

Der Hauptsitz der Parkverwaltung befindet sich in Glurns. Auch die Nationalparkhäuser – naturatrafoi, aquaprad, culturamartell, avimundus – liegen im Vinschgau – und eines, die lahnersäge, im Ultental. Diese vier Zentren beleuchten jeweils einen anderen geologischen, ökologischen oder kulturellen Teilaspekt dieses großartigen Ökosystems. So dreht sich im Nationalparkhaus aquaprad in Prad alles um das Element Wasser, während das Nationalparkhaus naturatrafoi in Trafoi am Stilfserjoch faszinierende Einblicke in die Geologie, Flora und Fauna der Ortlergruppe bietet. Avimundus in Schlanders ist der Vogelwelt gewidmet und culturamartell im Martelltal der bäuerlichen Kulturlandschaft.